ゾーン情報のシリアル値を上げ忘れていないか、お確かめください。
ゾーン情報の更新時にそれ以前よりシリアル値が増えていないと、セカンダリネームサーバがプライマリネームサーバの内容を反映する動作を行いません。
この場合、キャッシュの影響ではないため時間が解決しません。ゾーン情報のシリアル値を増やした上で、再度ゾーン情報のアップロードをお試しください。